2024-12-22 06:09:19
二代測(cè)序—全外顯子測(cè)序的優(yōu)勢(shì)
針對(duì)性強(qiáng):它主要聚焦于基因組中編碼蛋白質(zhì)的區(qū)域,這部分區(qū)域雖然只占整個(gè)基因組的 1 - 2% 左右,但包含了大部分與疾病相關(guān)的突變。例如,在研究孟德?tīng)栠z傳病時(shí),很多致病突變都位于外顯子區(qū)域,通過(guò)全外顯子測(cè)序可以更高效地找到這些突變。
成本效益高:相比于全基因組測(cè)序,全外顯子測(cè)序的成本相對(duì)較低。因?yàn)樗恍枰獙?duì)整個(gè)基因組(包括大量的非編碼區(qū)域)進(jìn)行測(cè)序,在一定程度上減少了數(shù)據(jù)量和測(cè)序成本,同時(shí)又能獲取大部分有重要功能意義的遺傳信息。 擴(kuò)增子測(cè)序是二代測(cè)序嗎?廣東二代測(cè)序
二代測(cè)序—全外顯子測(cè)序的原理是什么?
全外顯子測(cè)序主要是利用序列捕獲技術(shù),將基因組 DNA 中的外顯子區(qū)域富集起來(lái),然后通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)(如第二代測(cè)序技術(shù) Illumina 測(cè)序平臺(tái))對(duì)富集后的外顯子 DN**段進(jìn)行測(cè)序。其大致步驟包括 DNA 提取、片段化、文庫(kù)構(gòu)建、外顯子捕獲、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析等。例如,在文庫(kù)構(gòu)建過(guò)程中,將提取的基因組 DN**段化后,在片段兩端連接上特定的接頭序列,這些接頭序列可以用于后續(xù)的擴(kuò)增和測(cè)序反應(yīng)。然后通過(guò)與外顯子區(qū)域互補(bǔ)的寡核苷酸探針,將外顯子片段從全基因組 DNA 文庫(kù)中 “捕獲” 出來(lái),經(jīng)過(guò)清洗去除未結(jié)合的 DN**段后,對(duì)捕獲的外顯子文庫(kù)進(jìn)行大規(guī)模的平行測(cè)序。 靜安區(qū)二代測(cè)序分析二代測(cè)序通量大,可以產(chǎn)生上G的reads.
二代測(cè)序技術(shù)的一些***研究進(jìn)展③
技術(shù)優(yōu)化與創(chuàng)新領(lǐng)域
測(cè)序準(zhǔn)確性提高:通過(guò)改進(jìn)測(cè)序試劑、優(yōu)化測(cè)序反應(yīng)條件以及開(kāi)發(fā)更先進(jìn)的數(shù)據(jù)分析算法,二代測(cè)序技術(shù)的準(zhǔn)確性不斷提升,能夠更可靠地檢測(cè)到低頻變異和復(fù)雜結(jié)構(gòu)變異等。
成本進(jìn)一步降低:隨著技術(shù)的不斷成熟和市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)的加劇,二代測(cè)序的成本持續(xù)下降,使得更多的研究機(jī)構(gòu)和臨床實(shí)驗(yàn)室能夠廣泛應(yīng)用該技術(shù),推動(dòng)了基因組學(xué)研究和臨床診斷的發(fā)展。
法醫(yī)學(xué)領(lǐng)域
遺傳標(biāo)記檢測(cè):現(xiàn)有的二代測(cè)序技術(shù)平臺(tái)能夠完成 STR 遺傳標(biāo)記、SNP 遺傳標(biāo)記、mtDNA 及 mRNA 等遺傳標(biāo)記的測(cè)序,為法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別、親緣關(guān)系鑒定等提供了更豐富、準(zhǔn)確的遺傳信息。
技術(shù)應(yīng)用挑戰(zhàn)與應(yīng)對(duì):測(cè)序試劑盒中部分遺傳標(biāo)記的優(yōu)化、針對(duì)中國(guó)人群測(cè)序需求的試劑盒開(kāi)發(fā)、數(shù)據(jù)采信標(biāo)準(zhǔn)的制定、測(cè)序數(shù)據(jù)分析軟件的優(yōu)化以及與現(xiàn)有法醫(yī)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的對(duì)接等,是二代測(cè)序技術(shù)在法醫(yī)學(xué)領(lǐng)域廣泛應(yīng)用的關(guān)鍵,相關(guān)研究正在不斷推進(jìn)以解決這些問(wèn)題 。
二代測(cè)序——技術(shù)原理類(lèi)問(wèn)題
二代測(cè)序與一代測(cè)序的區(qū)別是什么:一代測(cè)序技術(shù)如Sanger測(cè)序,一次只能讀取一條DNA序列,通量低、速度慢、成本高,但準(zhǔn)確性高,適用于對(duì)少量基因片段的精確測(cè)序。而二代測(cè)序技術(shù)具有高通量、速度快、成本低等優(yōu)點(diǎn),可以同時(shí)對(duì)大量DNA分子進(jìn)行測(cè)序,但在單個(gè)堿基的準(zhǔn)確性上稍低于一代測(cè)序,二者在不同的應(yīng)用場(chǎng)景中各有優(yōu)勢(shì)。二代測(cè)序有哪些主要的測(cè)序原理:主要包括邊合成邊測(cè)序和連接法測(cè)序。邊合成邊測(cè)序是在DNA聚合酶的作用下,逐個(gè)添加帶有熒光標(biāo)記的dNTP,通過(guò)檢測(cè)釋放的熒光信號(hào)來(lái)確定堿基序列;連接法測(cè)序則是利用DNA連接酶將寡核苷酸探針連接到模板DNA上,根據(jù)連接的探針序列來(lái)推斷模板DNA的堿基組成。 denovo測(cè)序是二代測(cè)序嗎?
二代測(cè)序—全外顯子測(cè)序的應(yīng)用領(lǐng)域
醫(yī)學(xué)領(lǐng)域:1、疾病診斷:用于診斷各種遺傳性疾病,包括單基因遺傳病(如囊性纖維化、杜氏肌營(yíng)養(yǎng)不良等)和復(fù)雜疾病(如**、心血管疾病等)。在**研究中,通過(guò)對(duì)**組織和正常組織進(jìn)行全外顯子測(cè)序,可以發(fā)現(xiàn)腫瘤細(xì)胞中的體細(xì)胞突變,這些突變可能是導(dǎo)致**發(fā)生、發(fā)展的關(guān)鍵因素,有助于醫(yī)生制定個(gè)性化的**方案。2、藥物研發(fā):幫助研究人員了解藥物靶點(diǎn)的基因變異情況。例如,如果發(fā)現(xiàn)某些患者的藥物靶點(diǎn)基因外顯子區(qū)域存在突變,可能會(huì)影響藥物的療效,從而可以針對(duì)性地開(kāi)發(fā)新的藥物或者調(diào)整藥物的使用劑量和方式。
遺傳學(xué)研究:用于研究人類(lèi)群體的遺傳多樣性,通過(guò)對(duì)不同人群的外顯子測(cè)序,可以發(fā)現(xiàn)不同人群之間的基因差異,這些差異可能與人群的適應(yīng)性、易感性等有關(guān)。還可以用于追蹤基因的進(jìn)化歷程,了解基因在進(jìn)化過(guò)程中的變化情況。 二代測(cè)序的優(yōu)勢(shì)是高準(zhǔn)確性。上海嘉安健達(dá)二代測(cè)序檢測(cè)
宏基因組測(cè)序也是二代測(cè)序。廣東二代測(cè)序
對(duì)于二代測(cè)序的概念是什么?
第二代測(cè)序(Next-generationsequencing,NGS)又稱(chēng)為高通量測(cè)序(High-throughputsequencing),是基于PCR和基因芯片發(fā)展而來(lái)的DNA測(cè)序技術(shù)。我們都知道一代測(cè)序?yàn)楹铣山K止測(cè)序,而二代測(cè)序開(kāi)創(chuàng)性的引入了可逆終止末端,從而實(shí)現(xiàn)邊合成邊測(cè)序(SequencingbySynthesis)。二代測(cè)序在DNA復(fù)制過(guò)程中通過(guò)捕捉新添加的堿基所攜帶的特殊標(biāo)記(一般為熒光分子標(biāo)記)來(lái)確定DNA的序列,現(xiàn)有的技術(shù)平臺(tái)主要包括Roche的454FLX、lllumina的Miseq/Hiseg等。2005年,羅氏推出了二代測(cè)序儀羅氏454,生命科學(xué)開(kāi)始進(jìn)入高通量測(cè)序時(shí)代。2006年,隨著Ilumina系列測(cè)序平臺(tái)的推出,極大降低了二代測(cè)序的價(jià)格,推動(dòng)了高通量測(cè)序在生命科學(xué)各個(gè)研究領(lǐng)域的普及。 廣東二代測(cè)序